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台灣飛往馬來西亞的直飛航班平均需時16小時04分鐘，飛行距離為4517km。 最熱門的航線是台北往吉隆坡，平均需時4小時45分鐘。

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馬來西亞航空、中華航空及Batik Air經常提供台灣往馬來西亞的航班。 最熱門的航線是台北往吉隆坡，中華航空、Batik Air及馬來西亞航空經常提供此路線的航班。

KAYAK機票搜尋數據顯示最熱門的目的地是吉隆坡（佔飛往馬來西亞總搜尋量的78%）。其他熱門目的地有檳城和亞庇，分別佔總搜尋量11%和5%。 蘭卡威、古晉和詩巫同樣是熱門搜尋，分別佔總搜尋量1%、1%和1%。

KAYAK的機票價格預測工具使用歷史數據，以估計指定目的地和日期的價格會否在7天內有所改變，讓旅客知道應該立即預訂，還是等候一下。